De journaalpostregels voor verkoop- en inkoopfacturen in Isah zijn inclusief BTW. De BTW-code financieel bepaalt de soort BTW in de journaalpostregel. Het BTW-bedrag en het BTW-percentage worden in aparte kolommen in de journaalpostregel vermeld.

Voor de inkoopfactuur is een extra grootboekrekening beschikbaar om de BTW op te registreren, de zogenaamde BTW-tussenrekening. De BTW van de inkoopfactuurkop moet namelijk al bij het voorlopig verwerken van de inkoopfactuur geregistreerd worden. Het BTW-bedrag op de inkoopfactuur bepaalt de BTW bij de inkoopfactuur. Het BTW-percentage kan hiervan afwijken.

De BTW-code financieel bepaalt op welke grootboekrekening het BTW-bedrag uiteindelijk geboekt zal worden. Het feitelijk boeken op de BTW-rekening vindt plaats op het moment van de verwerking van de journaalpostregel in het financieel systeem. De uiteindelijke BTW-aangifte gebeurt ook vanuit het financieel systeem.